霍 毅欣

北京成人头条特聘教授（二级）、博士生导师

国家级领军人才（2022年入选）、国家级青年人才（2015年入选）

生命学院副院长、中国生物工程学会理事

北京成人头条学科专业责任教授（生物学学科、生物技术本科专业）

2024年第十四届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛主赛道金奖指导教师

计算生物学：基于深度学习的DNA和酶设计；微生物进化机制

基因编辑：原核、真核细胞的基因编辑、高鲁棒性底盘宿主构建；方法学开发

碳中和：二氧化碳的资源化，以固碳微生物实现二氧化碳的高值转化

代谢工程：大宗化学品、药物中间体的微生物合成途径构建及高效生产

酶工程：塑料降解酶；生物传感器的研发

2023年8月至今，北京成人头条， 生命学院，特聘教授（二级教授）
2021-01至2023年8月，北京成人头条，生命学院，长聘教授（三级教授）
2019-10至今，北京成人头条，生命学院，副院长（分管研究生、学科）
2019-09至今，北京成人头条，生命学院，生物技术专业责任教授
2019-01至今，北京成人头条，工业和信息化部“分子医学与生物诊疗”重点实验室，副主任
2017-09至2020-12，北京成人头条，生命学院，生物工程专业责任教授
2015-09至2020-12，北京成人头条，生命学院，教授
2014-11至2015-09，加州大学洛杉矶分校苏州先进技术研究院，生物能源研究中心，实验室主任（兼）
2011-08至2015-09，Nantworks集团Easel生物技术公司，项目主管、资深研究员

代表作

[1] Yan Xia, Xiaowen Du, Bin Liu, Shuyuan Guo*, Yi-Xin Huo^*. Species-specific design of artificial promoters by transfer-learning based generative deep-learning model. Nucleic Acids Research. 2024 May 23:gkae429. doi: 10.1093/nar/gkae429. Online ahead of print. （发表当年影响因子16.6，发表日期2024年6月）

针对非模式生物启动子训练数据集不足的问题，用迁移学习大模型实现对27种原核生物的物种特异性启动子的生成。

[2] Tingting Ding, Zeyu Liang, Yu Yang, Jing Liu, Wenting Li, Yuhui Du, Zhenya Chen, Yi-Xin Huo^*. Rapidly engineering an osmotic-pressure-tolerant gut bacterium for efficient non-sterile production of bulk chemicals. Chemical Engineering Journal. 2024 July 1. doi.org/10.1016/j.cej.2024.152076. （发表当年影响因子13.3，发表日期2024年7月）

从昆虫肠道中分离出来一种耐盐底盘菌株并建立全套基因编辑方法，可以高盐、非灭菌、非粮底物高效生产大宗化学品。

[3] Zeyu Liang, Chaoyong Huang, Yan Xia, Zhaojin Ye, Shunhua Fan, Junwei Zeng, Shuyuan Guo, Xiaoyan Ma, Lichao Sun, Yi-Xin Huo^*. Identification of functional sgRNA mutants lacking canonical secondary structure using high-throughput FACS screening. Cell Reports. 2024 May 31;43(6):114290. doi: 10.1016/j.celrep.2024.114290. Online ahead of print. （发表当年影响因子8.8，发表日期2024年6月）

筛选到2000余种完全失去经典二级结构的、序列高度变异的（up to 80%序列不同）、有（完全）活性的sgRNA，用于克服基因编辑中的重组和脱靶问题。

[4] Zhenya Chen, Shengzhu Yu, Jing Liu, Liwei Guo, Tong Wu, Peifeng Duan, Dongli Yan, Chaoyong Huang, Yi-Xin Huo^*. Concentration Recognition-Based Auto-Dynamic Regulation System (CRUISE) Enabling Efficient Production of Higher Alcohols. Advanced Science. 2024 Apr 16:e2310215. doi: 10.1002/advs.202310215. （发表当年影响因子15.1，发表日期2024年4月）

在氨基酸衍生物生产过程中实现胞内氨基酸浓度的动态调控，克服其因转化造成的浓度不足对底盘细胞的生长抑制问题。

[5] Zeyu Liang, Zhaojin Ye, Yan Xia, Xiaowen Du, Shunhua Fan, LiChao Sun, ShuYuan Guo* Yi-Xin Huo*. Low-cost and rapid construction of green energy overproducers based on the CRISPR system. 2024. Chemical Engineering Journal. （发表当年影响因子13.3，接收日期2024-12）

[6] Yan Xia^#, Lichao Sun^#, Zeyu Liang, Yingjie Guo, Jing Li, Dan Tang, Yi-Xin Huo^*, Shuyuan Guo^*, The construction of a PAM-less base editing toolbox in Bacillus subtilis and its application in metabolic engineering, Chemical Engineering Journal, 2023, 469:143865. DOI: 10.1016/j.cej.2023.143865 (发表当年影响因子16.744，发表年月 2023-05)

[7] Hao Guo^#, Ning Wang^#, Tingting Ding, Bo Zheng, Liwei Guo, Chaoyong Huang, Wuyuan Zhang, Lichao Sun, Xiaoyan Ma*, Yi-Xin Huo*. A tRNA Modification-based strategy for Identifying amiNo acid Overproducers (AMINO). Metab Eng. 2023. 78: 11-25. (发表当年影响因子8.4，发表年月 2023-07)

[8] Ning Wang, Yi-Xin Huo*. Using genome and transcriptome analysis to elucidate biosynthetic pathways. Curr Opin Biotechnol. 2022, 75: 102708. （发表当年影响因子10.279，发表年月2022-06）

[9] Tong Wu#, Zhenya Chen#, Shuyuan Guo, Cuiying Zhang, Yi-Xin Huo*. Engineering transcription factor BmoR mutants for constructing multifunctional alcohol biosensors. ACS Synth Biol. 2021（发表当年影响因子5.11，发表年月2022-02）

[10] Xiaoyan Ma#, Lianjie Ma#, Yi-Xin Huo*. Reconstructing the transcription regulatory network to optimize resource allocation for robust biosynthesis. Trends Biotechnol. 2021（发表当年影响因子21.932，发表年月2021-11）